W szpitalu funkcjonuje 13 oddziałów plus 2 pododdziały rozmieszczone w budynkach przy ul. Pyskowickiej 47-51 oraz przy ul. Opolskiej 21.

Przy ul. Pyskowickiej działają następujące oddziały:

1.  Oddział Pediatryczny

2.  Oddział Internistyczny I ( w tym Pododdział Nefrologiczny )

3.  Oddział Neurologiczny ( w tym Pododdział Udarowy)

4.  Oddział Okulistyczny

5.  Oddział Otolaryngologiczny

6.  Oddział Anestezjologii i Intensywnej Terapii

7.  Oddział Ginekologiczno-Położniczy z Salą Porodową ( II stopień referencji )

8.  Oddział Noworodkowy ( II stopień referencji )

9.  Oddział Chirurgiczny (w tym Pododdział Chemioterapii )

10. Oddział Urologiczny

11. Oddział Psychiatryczny

12. Szpitalny Oddział Ratunkowy

Przy ul. Opolskiej 21 aktualnie funkcjonuje jeden oddział:

1. Oddział Internistyczny II ( w tym Pododdział Kardiologiczny)